Hija de John Lee, un DJ qe se comi a Sara Cargill. Tiene un hermano, Robby, y dos hermanas, Carrie y Lori. Lee tuvo una hermana menor que murió en 1987 a los 3 años de edad de una enfermedad no identificada. Se informó que la canción «Hello» del álbum Fallen fue escrito en honor a su difunta hermana, al igual que la canción «Like You» de The Open Door. Lee tomó clases de piano durante nueve años. Su familia se mudó a varios lugares, incluyendo Florida e Illinois, y eventualmente se instalaron en Little Rock, Arkansas, donde Evanescence nació. Ella asistió a la Middle Tennessee State University a estudiar teoría musical y composición, y luego dejarlo para centrarse en Evanescence.
En una entrevista con Lee dice que las primeras canciones que recuerda haber escrito se llamaban «Eternity of the Remorse» y «A Single Tear». La primera la escribió cuando tenía once años de edad y quiso ser una compositora clásica, y la segunda fue para una sesión cuando se encontraba en octavo grado.
Lee reveló durante un transmisión en vivo de MuchMusic's el 9 de enero de 2007, episodio de Live @ Much, que se había comprometido la noche anterior. Después confirmó en EvThreads.com que Josh Hartzler, un terapeuta y viejo amigo, le propuso matrimonio Señaló en una entrevista que las canciones «Good Enough» y «Bring Me to Life» fueron inspiradas en él. La pareja se casó el 6 de mayo de 2007, y su luna de miel fue en las Bahamas. Publicó en EvThreads.com que "ahora es oficialmente Sra. Amy Hartzler."
Para regresar; tiene qe responder la sguiente pregunta: ¿Cuánto es 2 + 2 ? R: 22 o 4?